扩增子测序

扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。

16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目的区域，通过检测目的区域的序列变异和丰度，以研究环境微生物多样性及群落组成差异。

16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于5.8S和28S之间。

扩增子测序的优势：

采用目前Illumina HiSeq最长测序平台，可以满足16S 1~2个高变区的测序分析。3天内同时完成3,000个16S样本的测序，测序准确度较MiSeq平台提高10%，而拼接效率较MiSeq平台提高25%，以此获得更全面的菌群信息。

扩增子测序操作步骤：

1、研究对象的选取；

2、提取基因组DNA，DNA浓度需要达到5ng/ul,总量需要大于等于150ng;

3、构建PCR-free文库；

4、PE250测序;

5、信息分析  分析内容=标准分析+高级分析，基于目的区域的测序，检测序列丰度，以充分研究环境微生物多样性和群落差异性。

【服务流程】

【威斯腾生物服务项目】

【本平台合作项目】

分子生物学、细胞生物学、病理染色检测、细胞敲除/敲入、模式与转基因动物、SPF动物保种、免疫学检测、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、siRNA与纳米载药、ChIP、Co-IP、生物信息学分析、知识产权服务！

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