SNP筛查和鉴定(TaqMan法)
简介:
人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)。SNP的数量大、分布广,在组成人类基因组的30亿个碱基中,平均每1000个就有一个SNP。SNP作为第三代遗传标记,在复杂疾病的基因定位、关联分析、个体疾病易感性分析与药物基因组学的研究中发挥着愈来愈重要的作用。为适应日益增长的 SNP研究需求,和各类客户的不同需要,威斯腾生物中心利用多套技术方案为不同客户提供量身定做的个性化服务。
TaqMan探针法:
特点:
1、先进的荧光检测技术:一束激光扫描并激活96个孔的每一个孔里的荧光染料,实现多色荧光同时检测。2、通量大,速度快,一批样本分析只需2个小时;
原理:
1、聚合:在Taq Man探针的5'和3'端分别连接一个荧光报告(R)染料和一个淬灭物(Q)正向引物探针反向引物
2、链置:换当探针完整时,报告染料发射的荧光被淬灭
3、裂解:在每一次延伸循环中,DNA多聚酶将探针上的报告染料裂解出来
4、聚合完成:报告染料一旦与淬灭物分离即发出它特有的荧光
实验流程:
1、DNA提取,设计引物并合成
2、PCR
3、上机检测,数据采集以及分析
客户需知:
1、准确的基因名称和序列以及SNP位点信息
2、提供样品要:A、血液样品(至少4ml、需加EDTA);B、基因组DNA 样品,需-20度保存和运输
3、纯度要求:OD260/280在1.6~1.8之间;OD260/230在1.8~2.2之间
4、浓度要求( C) :基因组DNA浓度大于100ng/ul
5、单个PCR反应量(M):50ng
6、DNA用量需求( UL):PCR反应个数(N)* (M)/ (C)
结果提供:
1、提供电子版结果及实验流程
2、提供数据分析服务
3、实验数据及实验剩余的样品和引物为客户所有
实验费用:
1、DNA提取费用
2、引物设计及合成费用
3、PCR扩增费用
4、上机费用
5、数据分析费用
【服务流程】
【威斯腾生物服务项目】
【本平台合作项目】
分子生物学、细胞生物学、病理染色检测、细胞敲除/敲入、模式与转基因动物、SPF动物保种、免疫学检测、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、siRNA与纳米载药、ChIP、Co-IP、生物信息学分析、知识产权服务!
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