基因组文库(Genomic Library)构建
用限制性内切酶切割细胞的整个基因组DNA,可以得到大量的基因组DNA片段,然后将这些DNA片段与载体连接,再转化到细菌中去,让宿主菌长成克隆。这样,一个克隆内的每个细胞的载体上都包含有特定的基因组DNA片段,整个克隆群体就包含基因组的全部基因片段总和称为基因组文库。
载体的种类和特征:
受体细胞 | 结构 | 插入片段 | 举例 | |
质粒 | E.coli | 环状 | 很小,<8kb | pUC18/19 ,T-载体, |
λ噬菌体 | E.coli | 线状 | 9-24kb | EMBL,λgt系列 |
丝状噬菌体及噬菌粒 | E.coli | 环状 | <10kb | M13系列 |
粘粒载体 | E.coli | 环状 | 35-45kb | |
BAC | E.coli | 环状 | 约300kb | |
PAC | E.coli | 环状 | 100-800kb | PCYPAC |
YAC | 酵母细胞 | 线性染色体 | 100-2000kb | |
MAC | 哺乳动物细胞 | 环状 | >1000kb | |
病毒载体 | 动物细胞 | 环状 | SV40 载体,昆虫杆状病毒载体 | |
穿梭载体 | 动物细胞和细菌 | 环状 | pSVK3质粒,PBV,Ti质粒, |
基因组文库构建步骤:
1、载体:
l噬菌体:48.5kb,插入型(最多可容纳9kb)、取代型(可容纳 38-51kb,最适19-20kb), EMBL, Charon 粘性质粒(Cosmid):4-6kb, 质粒+噬菌体的性质,可容纳大片段的外源基因,最多可容纳46kb。
酵母人工染色体克隆体系(YAC,Yeast Artificial Chromosome Cloning System) 插入大小200—1000kb。
2、 载体DNA的制备: 高分子量的外源DNA 100-150kb
载体DNA酶切反应-----载体臂的纯化-----载体脱磷处理 (常用BamHI)(蔗糖密度梯度离心)(碱性磷酸酶)
3、连接和包装:外源片段与两臂之间的比例,包装蛋白
4、感染宿主菌:选择合适的宿主菌,LE392, NM538, NM539, KW251等
5、基因组文库的保存和扩增
6、测滴度,要在106fu以上
7、保存:氯仿4℃,7% DMSO -70℃
您需要提供:
动物的血或细胞、新鲜植物叶片、活体昆虫或纯化好的DNA样品。
我们提供:
1、文库(10%甘油菌)以及菌落效价(CFU/ml);
2、随机抽样测序结果。
【服务流程】
【威斯腾生物服务项目】
【本平台合作项目】
分子生物学、细胞生物学、病理染色检测、细胞敲除/敲入、模式与转基因动物、SPF动物保种、免疫学检测、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、siRNA与纳米载药、ChIP、Co-IP、生物信息学分析、知识产权服务!
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