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医学代谢组学

代谢组学(metabonomics/metabolomics)是研究关于生物体被扰动后其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在和外在因素的影响及随时间变化的规律。作为基因组、转录组和蛋白组的“终端”,能够更直接、更准确地反映生物体的病理生理状态。作为全局系统生物学的基础和系统生物学的一个重要组成部分,代谢组学是以物理学基本原理为基础的分析化学、以数学计算与建模为基础的化学计量学和以生物化学为基础的生命科学等学科交叉的学科。

一、样品采集原则

我们处理过各种类型的样品,包括各种动物(人、大鼠、小鼠、猴子、鸡、牛、羊、猪等)的血清/血浆,尿液,组织,唾液,淋巴液,膝盖滑液,舌苔,卵泡液,脑脊液,瘤胃液,粪便,细胞等。动物体液采样后要迅速预处理,如加入抗凝血剂、防腐剂,并立即冷冻处理(-80 ℃ )。

二、样品采集要求

血清:

1、样品量要求:

NMR:500µl/例 (不得低于200µl/例);

GC-MS or LC-MS: 200ul/例;一定避免反复冻融。

2、收集步骤:血液收集在离心管中静置30分钟进行凝固。然后3000rpm离心5分钟,取上清装载干净的离心管中,再离心5分钟,8000rpm,取上清分装到冻存管中,每管0.2 or 0.5ml,立即-80度冻存,直到干冰寄送。

3、注意事项:

(1)取血时如用酒精消毒,请擦干擦拭部位,待酒精完全挥发后再取样。

(2)取血时如用麻醉剂,建议用异氟醚 ,防止在NMR血清谱图中出现干扰峰。

(3)如要采用血浆,请务必使用肝素钠抗凝管。

尿液:

1、样品量要求:1ml/例,原则上可以多取一点。

2、收集步骤:尿液直接分装到离心管中,每管1ml,添加一滴(约10µl)质量体积为1/100(w/v)的叠氮化钠,-80度冻存寄送。

瘤胃液:

1、样品量要求:1ml/例,原则上可以多取一点。

2、收集步骤:瘤胃液经 6000×g 离心15min,取上清,分装, -80℃冷冻保存,干冰寄送。

为了让样品能保存更长的时间,取样之后可添加一滴(约10µl)质量体积为1/100(w/v)的叠氮化钠溶液。

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(分析获取的代谢通路图,以TCA cycle为例)






实验流程:

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【服务流程】

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【威斯腾生物服务项目】

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【本平台合作项目】

分子生物学、细胞生物学、病理染色检测、细胞敲除/敲入、模式与转基因动物、SPF动物保种、免疫学检测、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、siRNA与纳米载药、ChIP、Co-IP、生物信息学分析、知识产权服务!

 

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