ChIP-seq
ChIP-seq测序ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后,分离与其结合的基因组DNA片段,并通过高通量测序,在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点,且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。ChIP-seq优势:用于在全基因组范围中研究蛋白特异结合的DNA片段,组蛋白修饰和表观遗传修饰的技术,研究这三个主题有助于洞悉蛋白对基因表达的调控以及染色...
查看详情>>circRNA测序
环状 RNA(circRNA)是一类特殊的 RNA 分子,也是 RNA 领域的研究热点。与传统的线性 RNA(linear RNA,含 5’和 3’末端)不同,circRNA 分子呈封闭环状结构,不受 RNA 外切酶影响,表达更稳定,不易降解。近几年的研究表明,circRNA 在生物的生长发育、疾病的发生发展、对外界环境的抵御等方面具有重要的调控作用。由于 circRNA 的闭合环状特性...
查看详情>>扩增子测序
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目的区域,通过检测目的区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。ITS分为两个区域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和...
查看详情>>全基因组DNA甲基化测序
一、全基因组DNA甲基化测序:全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina HiSeq高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行高精准甲基化研究。WGBS可以达到单碱基分辨率,精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。二、全基因组DNA甲基化测序的优...
查看详情>>微生物基因组重测序
一、微生物基因组重测序:微生物种类繁多,菌株的分化速度快,需要有一个经济快速的方法,对大范围内的海量菌株进行测序研究,了解菌株间的变异信息。微生物基因组的重测序,是基于小片段文库的高通量测序数据,与近缘参考基因组进行比对,进行变异检测的方法。检测获得菌株和参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息,以精准快捷为特点,系统全面的检测变异信息。同时还可进一步进行物种进化、种群特征、选择压力等深入研...
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