ChIP-seq

ChIP-seq测序

ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后，分离与其结合的基因组DNA片段，并通过高通量测序，在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点，且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。

ChIP-seq优势：

用于在全基因组范围中研究蛋白特异结合的DNA片段，组蛋白修饰和表观遗传修饰的技术，研究这三个主题有助于洞悉蛋白对基因表达的调控以及染色体的功能结构。具有“覆盖全，周期快，分析科学”的优势，已广泛应用于人、小鼠、酵母、水稻、拟南芥等物种的研究。

ChIP-seq操作步骤：

1、研究对象的选取；

2、提取DNA样本，DNA量≥20ng;

3、ChIP-seq文库构建；

4、PE150测序（10-20Mb）;

5、信息分析，通过对IP下来的合格DNA样本，建库测序，获得高质量reads，根据SCC曲线判断IP效果，通过motif分析判断IP的特异性以及分析的可信性，高效预测相关基因，进行功能富集分析、预测特异蛋白的功能，组蛋白染色体结合图谱以及DNA的表观修饰。

案例分析

案例：雌***受体结合异常与乳腺癌临床试验的相关性研究

雌***受体（ER）可与相关基因结合形成复合体并移位到细胞核结合下游基因激活它们转录，为肿瘤生长助力。在许多乳腺患者体内，就是因为该受体影响了基因的功能，从而引发致癌连锁反应。现在常用的***等乳腺癌治疗药物，就是通过阻断雌***受体对基因的作用而发挥效果。但在不少患者身上，这种药物的效果并不理想。本研究基于高通量平台的染色质免疫共沉淀技术ChIP-seq全基因组范围内寻找ER结合位点，从而鉴定雌***结合模式是否在患者肿瘤中存在差异。 

 【服务流程】

【威斯腾生物服务项目】

【本平台合作项目】

分子生物学、细胞生物学、病理染色检测、细胞敲除/敲入、模式与转基因动物、SPF动物保种、免疫学检测、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、siRNA与纳米载药、ChIP、Co-IP、生物信息学分析、知识产权服务！

【全国免费热线】400-675-6758

【电话】 023-65227525

【邮箱】 china-western@163.com

【官网网址】www.cqwestern.net；www.cqwestern.com

【地址】 重庆市高新区二郎创业大道高科创业园D栋2楼