LncRNA测序
长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一类长度超过200 nt的长链非编码RNA,通过与DNA、RNA或蛋白质结合,在表观遗传、转录及转录后等水平调控基因表达。测序采用Illumina HiSeq平台进行测序,针对有参考基因组样本开展准确的lncRNA鉴定和lncRNA靶基因预测,同时提供针对测序数据中mRNA的分析,结果更全面,广泛应用于医学、农学研究领域。长...
查看详情>>small RNA测序
small RNA测序 小RNA是一类重要的体内调节分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。小RNA测序技术采用胶分离技术,收集样品中18-30nt的RNA片段,利用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息,依托强大的生物信息分析平...
查看详情>>ChIP-seq
ChIP-seq测序ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后,分离与其结合的基因组DNA片段,并通过高通量测序,在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点,且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。ChIP-seq优势:用于在全基因组范围中研究蛋白特异结合的DNA片段,组蛋白修饰和表观遗传修饰的技术,研究这三个主题有助于洞悉蛋白对基因表达的调控以及染色...
查看详情>>circRNA测序
环状 RNA(circRNA)是一类特殊的 RNA 分子,也是 RNA 领域的研究热点。与传统的线性 RNA(linear RNA,含 5’和 3’末端)不同,circRNA 分子呈封闭环状结构,不受 RNA 外切酶影响,表达更稳定,不易降解。近几年的研究表明,circRNA 在生物的生长发育、疾病的发生发展、对外界环境的抵御等方面具有重要的调控作用。由于 circRNA 的闭合环状特性...
查看详情>>扩增子测序
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目的区域,通过检测目的区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。ITS分为两个区域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和...
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